Um estudo metagenômico recente revelou um espectro notavelmente diverso de vírus e bactérias carregados por roedores na província de Heilongjiang, incluindo o vírus Lassa, o vírus Amur, a Salmonella e a Yersinia pestis.
A pesquisa utilizou oKit de enriquecimento de RNA de patógenos da Macro & Micro-TestBaseado na tecnologia de captura por sonda, o método, ao deplecionar seletivamente o rRNA do hospedeiro e outros fragmentos conservados do hospedeiro, reteve efetivamente o RNA microbiano, melhorando significativamente a sensibilidade da detecção de patógenos. Essa etapa de enriquecimento do RNA do patógeno foi crucial para alcançar uma alta taxa de detecção e forneceu um forte suporte técnico para a vigilância de patógenos.
Roedores: principais reservatórios de doenças zoonóticas
Os roedores são o grupo de mamíferos com maior diversidade de espécies e distribuição geográfica, compreendendo mais de 2.000 espécies em todo o mundo e representando mais de 40% de todas as espécies de mamíferos.
Além de sua importância ecológica, os roedores servem como importantes reservatórios e vetores de numerosos patógenos zoonóticos.Como os habitats de roedores frequentemente se sobrepõem aos ambientes humanos — por meio de mordidas diretas, contato com excrementos ou transmissão indireta por pulgas e ácaros — os patógenos que eles abrigam representam ameaças persistentes à saúde pública.
Notavelmente, mais de 70% das doenças infecciosas emergentes têm origem na vida selvagem, sendo os roedores um dos reservatórios virais mais importantes.
Região fronteiriça de Heilongjiang: uma linha de frente para a vigilância de patógenos
Heilongjiang, uma província fronteiriça no nordeste da China, possui abundantes recursos ecológicos e faz fronteira com vários países. A combinação de rica biodiversidade e frequente movimentação populacional transfronteiriça cria condições favoráveis à transmissão de patógenos.
Entre junho e julho de 2021, pesquisadores coletaram 67 roedores selvagens na cidade de Hengdaohezi, em Mudanjiang. As amostras incluíram:
l 20Península de Apodemus
l 47Myodes rufocanus
Todos os espécimes foram coletados em áreas residenciais e terras agrícolas circundantes, evidenciando a estreita relação entre os assentamentos humanos e os habitats da vida selvagem.
Tecnologia de Enriquecimento de Patógenos: Superando a Interferência do Hospedeiro
No sequenciamento metagenômico, o RNA do hospedeiro normalmente domina as sequências de leitura, mascarando os sinais de patógenos de baixa abundância.
Para enfrentar esse desafio, o estudo empregouKit de Detecção Metagenômica de Patógenos da Macro & Micro-Test. Utilizando a tecnologia de captura por sonda, sondas especificamente projetadas se ligam ao rRNA do hospedeiro e a sequências conservadas, permitindo sua depleção e, assim, o enriquecimento do RNA microbiano.
Essa abordagem melhorou substancialmente a sensibilidade da detecção de patógenos, permitindo que o sequenciamento subsequente recuperasse uma proporção maior de leituras de patógenos. A etapa de enriquecimento estabeleceu uma base sólida para a caracterização precisa do espectro de patógenos presentes em roedores.
Após o enriquecimento, as amostras de RNA foram submetidas à transcrição reversa, construção de bibliotecas e sequenciamento de alto rendimento. A análise bioinformática incluiu:
l Filtragem do genoma do hospedeiro
Classificação taxonômica usando o Kraken2
Correção de abundância com Bracken
Este fluxo de trabalho gerou um perfil abrangente das comunidades virais e bacterianas.
Resultados da pesquisa: Cocirculação de múltiplos vírus e bactérias
Resultados Virais
Os vírus detectados pertenciam a 21 famílias virais, incluindoArenaviridaeeHantavírus.
Atravésde novoA montagem utilizando o Megahit gerou 154 contigs virais, dos quais 110 se alinharam com 19 vírus de oito famílias.
In Península de ApodemusOs seguintes vírus foram identificados:
l Arenavírus: vírus Lassa, vírus Wenzhou, vírus Gairo
l Hantavírus: vírus Amur, vírus Puumala
In Myodes rufocanusForam detectados o arterivírus de rato e o vírus Amur.
Entre esses patógenos:
O vírus de Lassa é um agente causador da febre hemorrágica viral, com taxas de mortalidade que chegam a aproximadamente 20%.
O vírus Amur é um dos patógenos responsáveis pela febre hemorrágica com síndrome renal (FHSR). A China apresenta a maior incidência global de infecções por hantavírus.
Resultados Bacterianos
Um total de 1.051 gêneros bacterianos foram anotados.
Os gêneros mais abundantes foram:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
SalmonellaÉ um importante patógeno transmitido por alimentos, responsável por cerca de 9 milhões de casos de febre tifoide e aproximadamente 110.000 mortes anualmente em todo o mundo.
Yersinia pestisO Plasmodium, agente causador da peste, foi responsável por três pandemias históricas. A província de Heilongjiang é reconhecida como um dos focos naturais da peste na China e continua sendo uma região prioritária para a vigilância da doença.
Significado do estudo
Contribuições Científicas
Este estudo representa o primeiro relato de fragmentos do vírus Lassa e do vírus da arterite de ratos em roedores de Heilongjiang, ampliando o banco de dados de patógenos transmitidos por roedores na China.
O estudo caracteriza sistematicamente as comunidades virais e bacterianas em populações locais de roedores, fornecendo dados de referência para a vigilância de doenças zoonóticas em regiões fronteiriças.
Implicações para a Saúde Pública
Os resultados destacam a necessidade de vigilância contínua e rastreio de patógenos.A. penínsulaeM. rufocanus.
Os dados fornecem evidências científicas que apoiam estratégias de controle da fonte de doenças como a peste e a febre hemorrágica com síndrome renal.
Pontos fortes metodológicos
O sequenciamento metagenômico permite a detecção imparcial de patógenos conhecidos e novos.
Neste estudo, a tecnologia de enriquecimento de patógenos da Macro & Micro-Test demonstrou um desempenho robusto, aprimorando efetivamente a detecção do patógeno alvo em amostras biológicas complexas. Os resultados confirmam sua capacidade de auxiliar na identificação de patógenos com alta sensibilidade na vigilância da vida selvagem.
Recomendação de produto
Com base na sua aplicação bem-sucedida neste estudo, o kit de enriquecimento de RNA de patógenos Macro & Micro-Test é altamente recomendado para pesquisas de vigilância metagenômica.
Ao deplecionar eficientemente os ácidos nucleicos do hospedeiro e enriquecer as sequências microbianas, o kit melhora significativamente a sensibilidade de detecção e a qualidade dos dados. Ele representa uma ferramenta essencial para a descoberta precisa de patógenos em amostras complexas e fornece um suporte técnico robusto para a vigilância em saúde pública, avaliação de risco zoonótico e preparação para surtos.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Data da publicação: 02/03/2026